Juan Carlos Fernández, cuando era director de Seguridad de la Ciudad de la Justicia y hombre de confianza del entonces consejero de Justicia, Alfredo Prada, podría haber tenido información confidencial sobre el consejero de Interior Francisco Granados,según publica el diario El País. Tales documentos estarían guardados en el ordenador que le fue requisado por los supuestos espías,
Según este periódico, el dossier podría revelar información sobre el patrimonio de Granados y le vinculaba, al parecer. con empresas constructoras. El diario, no obstante, indica que fuentes del entorno de Granados niegan que el contenido de los documentos fuera sobre el patrimonio del consejero de Interior, sino información sobre el vicepresidente de la Comunidad Ignacio González. La Comunidad no ha reconocido hasta ahora saber el contenido del ordenador requisado al segundo de Prada.
Además, según el diario El Mundo, el ex policía Marcos Peña, contratado por la consejería de Interior, pudo urdir en mayo de 2006 un bulo contra el presidente del Gobierno Jose Luis Rodríguez Zapatero, relacionado con un supuesto trato de favor que tendría relación con el fraude de la empresa filatélica Afinsa. La empresa estafó supuestamente a 140.000 clientes. La información falsa publicada por El Mundo entre mayo y junio de 2006 tenía como fuente al citado ex policía. El diario fue condenado judicialmente a pagar una sanción de 18.000 euros.
Por otro lado, en una entrevista del diario El Economista, Granados asegura que la polémica por el control de Caja Madrid ha podido crear "algunos enemigos" al Gobierno regional dentro de esa entidad, que podrían "ser autores" de la trama de espionaje en la Comunidad.
El consejero, que insiste en que detrás de este asunto debe haber "gente muy poderosa, con muchos medios, estructura y dinero", no ve motivo para sospechar del Ministerio del Interior, pero "supone" que, a raíz del "affaire" de Caja Madrid, "nos habremos creado algunos enemigos que estarán en las listas de posibles autores o beneficiarios de lo que está ocurriendo".
Por otro lado, el sindicato Unión de a Policía Municipal (UPM) denunció este domingo que el alcalde Alberto Ruiz-Gallardón posee una "unidad parapolicial" a su servicio. La unidad estaría integrada por 20 agentes de élite que actúan al margen de la estructura del Cuerpo dirigidos por Juan Carlos Durán Bezanilla, antiguo sargento de la Guardia Real, según publica el diario El Mundo.