El Tribunal de Cuentas ha detectado que la UNED excedió en 2012 las retribuciones satisfechas a su personal docente investigador y al de administración y servicios sobre los importes autorizados en 2012, por un total de 5,12 millones de euros, según se desprende del informe de fiscalización que el órgano ha realizado sobre el centro universitario ese año.
