Nacida en Madrid en 1977, Begoña Villacís decidió que quería ser abogada mientras veía la película 12 hombres sin piedad, de Sidney Lumet. Tras su etapa escolar en el colegio concertado de La Salle San Rafael, se licenció en Derecho por la Universidad San Pablo-CEU y realizó un máster en Asesoría Fiscal y Derecho Tributario en la Universidad Pontificia Comillas.
En 2003 empezó a trabajar en el despacho de abogados Legálitas como responsable de las Áreas de Derecho Tributario, Laboral y Mercantil y, en calidad de analista en temas de derecho, colaboró de forma habitual en programas como Amigas y conocidas, El gato al agua, España Directo o La mañana de La 1. Precisamente en una tertulia televisiva conoció a Albert Rivera, presidente de Ciudadanos, partido con el que ya simpatizaba, con el que empezó a colaborar de forma activa en 2014 y al que terminaría afiliándose en 2015.
Aunque ese mismo año, Vox contactó con ella para ofrecerle un puesto en la candidatura para la Asamblea de Madrid en las autonómicas de ese año. Sin embargo, prefirió quedarse en Ciudadanos, y concurrió a las primarias del partido que la erigieron como candidata a la Alcaldía madrileña. Una candidatura que logró siete concejales. Villacís ha ejercido desde entonces como portavoz del grupo municipal de Ciudadanos en el pleno del Ayuntamiento.
Begoña Villacís está casada y es madre de tres niñas, la última, nacida durante la campaña del 26-M.