Los paros en Cercanías se iniciaron a las 6 de la mañana del día 3 de noviembre, y desde ese momento un grupo de maquinistas del centro de trabajo de Fuencarral se negó a iniciar la circulación de los trenes contemplados en los servicios mínimos, con lo que se suspendieron 46 servicios, lo que provocó innumerables retrasos en las líneas objeto del paro y aglomeraciones de viajeros. Las líneas perjudicadas fueron la C-1 (Alcalá de Henares-Alcobendas/San Sebastián de los Reyes), C-2 (Guadalajara-Chamartín), C-7 (Alcalá de Henares - Chamartín-Colmenar Viejo), C-8 (El Escorial-Villalba-Chamartín) y C-10 (Villalba-Príncipe Pío). En las líneas del Sur de Madrid, las más utilizadas de la red, la circulación se desarrolló con normalidad.

La huelga en las Cercanías se repitió durante dos días más. Los trabajadores de Renfe, que realizaron esta protesta para reclamar mejoras laborales, entre ellas, una subida sustancial del salario mensual, cumplieron "escrupulosamente" los servicios mínimos pactados para las horas puntas. Ello permitió el funcionamiento del 75% de los trenes, por lo que durante las dos siguentes mañanas hubo relativa normalidad en la red de Cercanías.